Die MMC Regensburg wird geführt vom Zentralpräses Monsignore Thomas Schmid, BGR, dem Präfekten Peter Krikorka, den Assistenten Johann Faltermeier, Max Pravida und Reinhard Schöftenhuber sowie den Consultoren Herbert Ettle, Helmut Konrad und Erwin Seitz.  Der Marianische Rat unterstützt den Zentralpräses bei der Leitung, Betreuung und Verwaltung der Congregation. Die Consultoren des Marianischen Rates werden aus den Bezirken entsandt. Für die Obmänner finden zweimal im Jahr sog. Obmännertage zur Koordination der Veranstaltungen statt.

Die Gesamtcongregation Regensburg ist gegliedert in 13 Bezirke und in z.Zt.179 Pfarrcongregationen, die von Priestern als Bezirks- bzw. Pfarrpräses und Bezirks- bzw. Pfarrobmännern betreut werden. Zum 30.09.2023 sind 3923 Sodalen registriert (162 Einzelsodalen).